Sau khi tiêu diệt chiếc mề đay ở phần trước, bộ ba Harry, Ron và Hermione tìm đến chỗ cha của Luna là Xenophillius Lovegood để hỏi về một ký hiệu mà họ đã thấy trên trang phục ông mặc, giống với hình vẽ tay trong quyển truyện cổ tích của Hermione. Ông nói rằng đó là biểu tượng của Bảo bối tử thần, ba đồ vật huyền thoại có thể chế ngự cái chết: Cây đũa phép Cơm nguội, Hòn đá Phục sinh và chiếc Áo khoác Tàng hình. Khi bị hỏi về sự vắng mặt của Luna, ông Lovegood thú thật rằng bọn Tử thần thực tử đã bắt cóc cô bé, và ông ta đã báo cho chúng là ba người đang ở đây; nhưng họ đã kịp trốn chạy. Những kẻ đi săn để lĩnh thưởng bắt được bộ ba ở nơi họ nghỉ chân, sau khi Harry lỡ thốt ra cái tên Voldemort. Họ bị giam tại dinh thự nhà Malfoy, cùng với Luna Lovegood, cụ Ollivander, Dean Thomas và yêu tinh Griphook. Tìm thấy thanh kiếm Gryffindor giữa những vật dụng của ba người, Bellatrix Lestrange nghi ngờ họ đã đột nhập vào hầm bạc của mụ ở Ngân hàng Gringotts và tra khảo Hermione. Lúc đó, Dobby độn thổ vào hầm giam để giải cứu các tù nhân. Peter Pettigrew đi đến kiểm tra khi nghe thấy tiếng ồn ào. Hắn chẹn cổ Harry, nhưng cậu nói với hắn rằng hắn đã nợ cậu mạng sống của mình (HP3). Pettigrew thả tay, và bàn tay bạc của hắn đã siết cổ chính hắn đến chết như một sự trừng phạt cho tội trái lệnh Chúa tể, Harry cố gắng cứu lấy hắn nhưng không được. Harry và Ron vội chạy lên tầng trên để cứu Hermione. Ron tước khí giới Bellatrix còn Harry lấy đũa phép của Draco. Dobby lại xuất hiện, tất cả họ cùng độn thổ tới nhà của Bill và Fleur Weasley. Nhưng ngay trước khi họ chạy đi, Bellatrix ném con dao của mụ vào Dobby và chú gia tinh tử thương.

Ở nhà Bill và Fleur, cụ Ollivander xác nhận sự tồn tại của Cây đũa phép Cơm nguội, và nói rằng một cây đũa phép có thể đổi chủ nếu người chủ trước của nó bị đánh bại hoặc bị giải giới. Hành vi của Bellatrix làm bộ ba tin rằng một Trường sinh linh giá khác cũng đang được cất giấu ở hầm bạc Lestrange. Được Griphook giúp đỡ, họ đột nhập Ngân hàng Gringotts, vào được căn hầm và lấy đi Chiếc cúp của Helga Hufflepuff. Việc đột nhập bị bại lộ, Griphook lợi dụng lúc hỗn loạn giật lấy thanh kiếm Gryffindor từ tay Harry, vì cho rằng thanh kiếm này đúng ra thuộc về các yêu tinh. Ba đứa trẻ phóng thích con rồng canh giữ kho báu rồi cưỡi nó bay thoát khỏi Gringotts. Trong khi đó, Voldemort đã đánh cắp Cây đũa phép Cơm nguội từ ngôi mộ của cụ Dumbledore, đồng thời phát hiện ra những Trường Sinh Linh Giá của hắn đang bị phá hủy dần. Suy nghĩ của hắn vô tình nối với Harry, để lộ ra việc một Trường Sinh Linh Giá được cất giấu tại Hogwarts. Cả ba độn thổ đến làng Hogsmeade và suýt bị bọn Tử thần thực tử phát hiện, họ được Aberforth Dumbledore – em trai cụ Albus Dumbledore cứu. Cả ba muốn vào trường Hogwarts để tìm kiếm cái Trường sinh linh giá, cả ba đến được Phòng Theo Yêu Cầu – nơi Đoàn quân Dumbledore đang tập họp. Harry nói cho tất cả các bạn biết là cậu đang cần tìm một vật của sư mẫu Rowena Ravenclaw, lúc đó Luna có nói rằng vật đó có thể là chiếc vương miện nhưng nó đã mất tích từ cả ngàn năm về trước và chỉ có Helena Ravenclaw (con gái của Rowena Ravenclaw) mới biết được nơi cất giấu chiếc vương miện đó. Bỗng nhiên Ginny Weasley xuất hiện nói rằng Severus Snape đã biết được nhóm bạn Harry ở Hogsmeade và tất cả đã bị Snape triệu tập ở Đại Sảnh và cảnh báo rằng nếu bất kì ai có tin tức gì về Harry Potter mà không tự giác khai báo, nếu bị phát hiện sẽ bị xử phạt thích đáng, bỗng nhiên Harry xuất hiện đồng thời Ron, Hermione và các Thần Sáng khác cũng xuất hiện. Snape định tấn công Harry nhưng giáo sư McGonagall đã phản đòn sau đó, Severus Snape bỏ trốn. Sau đó, Voldemort đã nói trực tiếp vào tiềm thức của mỗi người rằng hãy giao nộp Harry Potter cho hắn và sẽ để Hogwarts yên ổn, nhưng tất cả đều về phe của Harry chống lại Voldemort (ngoại trừ nhà Slytherin đã bị giáo sư McGonagall yêu cầu thầy giám thị Filch giam vào ngục). Trong khi các giáo viên trong trường tạo lớp bảo vệ cho Hogwarts để cầm chân Voldemort, còn Ron và Hermione thì đến căn phòng bí mật để lấy nanh tử xà Basilisk và tiêu diệt trường sinh linh giá là chiếc cốc của Helga Hufflepuff, còn Harry thì đi tìm Helena Ravenclaw ở tháp Ravenclaw và đã tìm ra được chiếc vương miện nằm trong Phòng Cần Thiết sau một hồi thuyết phục. Sau khi tìm được chiếc vương miện, Harry bị Draco và nhóm bạn của hắn yêu cầu giao nộp lại cho chúng chiếc vương miện, đúng lúc đó Ron và Hermione đến cứu Harry kịp thời, nhưng rồi cả lũ suýt mất mạng vì phép Fiendfyre do Gregory Goyle tạo ra và hắn cũng bị thiêu rụi bởi chính ngọn lửa mình tạo ra. Nhóm bạn Harry giải cứu Draco và kịp thời sống sót và phá hủy chiếc vương miện đó trong ngọn lửa. Sau đó tâm trí của Harry và Voldemort liên kết với nhau và biết rằng Nagini chính là Trường Sinh Linh Giá cuối. Trong lúc đó, ở một căn nhà khác, Voldemort yêu cầu Lucius triệu hồi Snape đến đây, vì Voldemort nghĩ rằng Snape chính là chủ nhân của cây đũa phép cơm nguội nên đã yêu cầu Nagini giết chết Snape, đúng lúc đó nhóm bạn Hary đến và Snape muốn Harry đựng giọt nước mắt của ông và mang nó đến Chậu Tưởng Kí, sau đó Voldemort nói trực tiếp vào tiềm thức của Harry rằng hãy tự giao nộp mình cho hắn nếu không hắn sẽ giết hết nhưng người còn sống ở Hogwarts. Harry lên văn phòng của cụ Dumbledore và xem kí ức của thầy Snape đã che giấu bấy lâu nay và biết được rằng vào cái đêm mà Voldemort tìm đến nhà để giết Harry thì mẹ của Harry (Lily) đã phản lại lời nguyền của Voldemort khiến hắn biến mất và vô tình biến Harry trở thành một Trường Sinh Linh Giá của Voldemort. Sau đó Harry đến khu rừng Cấm sẵn sàng để Voldemort giết. Trong tiềm thức của Harry sau khi bị giết, Harry gặp cụ Dumbledore ở Ngã Tư Vua, hai người họ nói chuyện với nhau rồi cụ Dumbledore biến mất và Harry tỉnh dậy nhưng vẫn giả vờ chết. Rồi Voldemort cùng các Tử Thần Thực Tử đến Hogwarts và có ý định nhập tất cả các nhà vào thành nhà Slytherin rồi bất ngờ Harry tấn công khiến Voldemort tức giận đuổi theo, Harry và Voldemort đã chiến đấu với nhau trong khi con rắn Nagini thì bị Neville giết bằng thanh gươm Gryffindor. Voldemort bị tiêu diệt, thời đại bóng tối chính thức chấm dứt.

Harry cưới Ginny và 19 năm sau họ có ba người con: James Sirius, Albus Severus và Lily Luna. Ron và Hermione cũng đã cưới nhau và có hai đứa con: Rose và Hugo. Hai gia đình gặp nhau tại Ngã Tư Vua, nơi Albus khởi hành đến Hogwarts. James là đứa con lớn nhất và đang học năm thứ 2 tại Hogwarts, còn Lily chưa đến tuổi vào trường. James bắt gặp con trai đỡ đầu của ba mình là Teddy Lupin đang hôn Victoire Weasley (con của Bill và Fleur) trong toa xe lửa. Theo lời Harry thì Ted thường đến ăn cơm với gia đình bốn lần trong một tuần. Harry mong rằng Teddy sẽ thực sự trở thành người trong nhà nếu cưới Victoire. Harry và Ron nhận ra Malfoy đi cùng với vợ và con trai Scorpius của họ. Malfoy gật đầu chào Harry rồi bỏ đi. Harry an ủi Albus, đứa con đang lo lắng sẽ bị phân loại vào nhà Slytherin vì những lời đồn xấu về Nhà này. Harry nói rằng Severus Snape là người nhà Slytherin, và đó là một người dũng cảm nhất mà Harry từng biết. Harry cũng nói thêm rằng cái nón phân loại cũng rất coi trọng sự lựa chọn của mỗi người. Neville Longbottom trở thành giáo sư môn Thảo dược học.